Этот музей работает при Харьковском национальном университете имени В. Н. Каразина. Он существует почти со времён создания самого университета. Фактически открыл свои двери в 1807 году, когда на базе университета был создан кабинет редкостей. В этом же году в кабинет стали поступать различные артефакты, предметы старины и интересные находки. Чуть позже арсенал музея пополнился этнографической коллекцией, собранной доктором Ландбадом во время первой русской кругосветной экспедиции в 1803–1806 годах под руководством И. Ф. Крузенштерна. Данный музей является обладателем старейших фондов не только Харькова, но и других регионов страны.В 1837 г. при Харьковском университете был создан Музей изящных искусств и древностей, куда были переданы коллекции разных кабинетов, в том числе кабинета древностей. Коллекция музея пополнялась довольно медленно. Многие экспонаты музей получил благодаря пожертвованиям.